К моменту колонизации Африки европейскими странами в Южном Судане не существовало государственных образований в современном понимании. Арабы не смогли освоить этот регион. Некоторый прогресс произошёл при османском правлении Египтом, когда в 1820—1821 годах зависимый от Порты режим Мухаммеда Али начал активную колонизацию региона.

В период существования англо-египетского Судана (1898—1955 гг.) Великобритания старалась ограничить исламское и арабское влияние на Южный Судан, введя отдельное управление соответственно Севером и Югом Судана,

В 1956 году было провозглашено создание единого суданского государства со столицей в Хартуме, а в управлении страной закрепилось доминирование политиков с Севера, пытавшихся проводить арабизацию и исламизацию Юга. Подписание в 1972 году Аддис-абебского соглашения привело к прекращению 17-летней Первой гражданской войны (1955—1972) между арабским Севером и христианским Югом и предоставлению Югу определённого внутреннего самоуправления.

После примерно десятилетнего затишья захвативший власть в результате военного переворота 1969 года Джафар Нимейри возобновил политику исламизации, после чего вооружённый конфликт возобновила Народная армия освобождения Судана.

Переговоры между повстанцами и правительством в 2003—2004 годах формально завершили 22-летнюю вторую гражданскую войну, хотя отдельные вооружённые столкновения в ряде южных районов имели место и позже. 9 января 2005 года в Кении было подписано Найвашское соглашение, предоставившее региону автономию, а лидер Юга Джон Гаранг стал вице-президентом Судана.

С 9 по 15 января 2011 года в Южном Судане прошёл референдум по вопросу независимости от Судана. Официальные результаты референдума были объявлены 7 февраля, согласно им, за отделение Южного Судана было подано 98,83 % от общего числа признанных действительными бюллетеней. Официальное провозглашение нового государства произошло 9 июля 2011 года.

В настоящее время период независимости характеризуется политической нестабильностью, вооружёнными конфликтами, в том числе и межрелигиозными, а также признаками зарождающейся гражданской войны .

Доколониальный период Римская экспедиция Достоверных сведений о том, как развивалась территория современного Южного Судана до XVIII века, почти не существует. В течение многих столетий болота Судд и особенно их густая растительность служили непреодолимым препятствием для судоходства по Нилу. В 61 году нашей эры отряд римских легионеров, посланный императором Нероном, двинулся вверх по Белому Нилу, но не смог преодолеть болота Судд, которые обозначили предел проникновения римлян в экваториальную АфрикуL. P. Kirwan, "Rome beyond The Southern Egyptian Frontier" , Geographical Journal, 123 (1957), pp. 16f. По тем же причинам в более поздние времена поиски истока Нила были особенно трудными; в конечном итоге для этого потребовались сухопутные экспедиции с побережья Центральной Африки, чтобы избежать необходимости путешествия через болота Судд.

Нилотическое расселение из болот Судд

Лингвистические данные показывают, что со временем нилотские народы, такие как динка, шиллук, нуэр и ло, начали активно осваивать данную территорию. Эти народы расселялись из суддских болот, где археологические свидетельства показывают, что культура, основанная на отгонном скотоводстве, существовала с 3000 года до н.э., и, таким образом, нилотская культура в этой области сохранилась до сих пор. Археологические свидетельства существования на этой местности нилотов, включают их куполообразные дома и тукулы, показывают, что они, возможно, внесли огромный вклад в систему управления и богатство Нубии до и во время господства XXV династии в ЕгиптеPeter Robertshaw. "Prehistory in the upper Nile Basin." The Journal of African History (1987), 28: 177-189.Cambridge University Press.

Нилотская экспансия из Суддских болот в остальную часть Южного Судана, по-видимому, началась в XIV веке. Это совпадает с падением христианских нубийских царств Макурия и Алодия под ударами арабских мусульманских захватчиков продвигавшихся в центральный Судан. От арабов южносуданцы, возможно, получили новые породы безгорбого скота. Археолог Роланд Оливер отмечает, что этот период также свидетельствует о начале железного века у нилотов. Эти факторы могут объяснить, как носители нилотских языков распространились и стали доминировать в регионе.

Проникновение носителей центральносуданских языков Примерно до 1500 года обширные районы Южного Судана стали контролировать носители центральносуданских языков. До наших дней сохранилось только несколько групп разговаривающих на центральносуданских языках, таких как Маади и Мору.

Племена шиллук

К XVI веку самой могущественным племенем среди носителей нилотского языка были шиллуки, которые распространились на восток до берегов Белого Нила под руководством легендарного вождя Ньиканга, который, как говорят, правил шиллуками с 1490 по 1517 годPatricia Mercer. "Shilluk Trade and Politics from the Mid-Seventeenth Century to 1861." The Journal of African History 1971. Page 410 of 407-426. Шиллуки получили контроль над западным берегом реки так далеко на север, как кости в Судане. Там они начали своё хозяйство основанное на выращивании зерновых культур и рыболовстве, с постоянными поселениями, расположенными вдоль реки"Shilluk." Encyclopedia of the Peoples of Africa and the Middle East, Volume 1 Infobase Publishing, 2009. Шиллуки развили интенсивную систему земледелия, и земли шиллуков в XVII веке имели плотность населения, аналогичную плотности населения земель египетского НилаNagendra Kr Singh. "International encyclopaedia of Islamic dynasties." Anmol Publications PVT. LTD., 2002 pg. 659.

Одна из теорий состоит в том, что именно давление со стороны шиллуков вынудило народ фундж уйти на север, где они основали султанат Сеннар. Динка оставались в районе болот Судд, продолжая свою практику отгонного животноводства"Dinka." Encyclopedia of the Peoples of Africa and the Middle East, Volume 1 Infobase Publishing, 2009.

В то время как динка были защищены и изолированы от своих соседей, шиллуки были более вовлечены во внешние дела. Шиллуки контролировали западный берег Белого Нила, но другая сторона контролировалась султанатом Фундж, и между ними происходили регулярные конфликты. Шиллуки обладали способностью быстро совершать набеги на внешние территории султаната на боевых каноэ и контролировали воды Нила. У Фунджа была постоянная армия состоящая из бронированной кавалерии, и эта сила позволяла им господствовать на равнинах сахеля.

Традиции шиллуков рассказывают о вожде Одаке Околло, который правил около 1630 года и возглавил их в тридцатилетней войне с Сеннаром за контроль над торговыми путями Белого Нила. Шиллуки вступили в союз с султанатом Дарфур и государством Такали против Фунджа, но разгром Такали закончил войну в пользу Фунджа. В конце XVII века шиллуки и Фундж объединились против джиенгов, группы динка, которые пришли к власти в пограничной области между Фунджем и Шиллуком. Политическая структура шиллуков постепенно централизовалась под руководством верховного вождя или рета. Самым важным является рет Туго, который правил с 1690 по 1710 год и основал шиллукскую столицу Кодок. В тот же период произошёл постепенный крах султаната Фундж, в результате чего шиллуки полностью контролировали Белый Нил и его торговые пути. Военная мощь шиллуков была основана на контроле над рекой.

Племена занде В XVI веке, в результате племенных миграций, в регионе появились люди занде, не принадлежавшие к нилотской группе и вскоре установившие господство над Южным Суданом. Занде основали крупнейшее государство региона. Занде это третья по численности национальность в Южном Судане. Они встречаются в округах Мариди, Иба, Ямбио, Нзара, Эзон, Тамбура и Нагере в поясе тропических дождевых лесов западной экватории и Бахр-эль-Газаль. В XVIII веке сюда вторгся народ авонгара и быстро установил свою власть над занде. Власть авонгара оставалась в значительной степени неоспоримой до прихода британцев в конце XIX векаMetz, Helen Chapin, ed. Sudan: A Country Study. The Turkiyah, 1821-85 Washington: GPO for the Library of Congress, 1991..

У занде развились государства, в которых доминировали семьи аристократов из авонгара, проводившие ассимиляционистскую политику, основанную на превращении покорённых народов в подданных вождя и знати. Это было сделано с помощью системы воинской повинности, которая позволяла призывать подданных правителя в качестве солдат в полки или в качестве земледельцев, что позволяло получать излишки продовольствия, и перераспределять его для тех, кто в нём нуждался. Государства занде использовали испытание испытанием как средство оценки вины или невиновности при отправлении правосудия и закона с помощью яда, который использовался в качестве оракула. Династическая преемственность при занде представляла собой сложную систему, в которой сыновья вождей получали пограничные провинции государства, что позволяло сыновьям вождей расширять свои владения и распространять власть за пределы государства, создавая свои собственные. Эти завоевания привели бы к включению суданских банту и нилотских народов в их государства, которые были в дальнейшем ассимилированы путём принятия языка занде, эти государства ранее простирались от современных Центральноафриканской республики и Демократической Республики Конго, до современного Южного Судана.

Географические барьеры защитили южных суданцев от наступления ислама, позволив им сохранить своё социальное и культурное наследие, а также свои политические и религиозные институты. Народ динка чувствовал себя в особой безопасности в болотистых землях Судда, которые защищали их от внешнего вмешательства и позволяли им оставаться в безопасности без крупных армий. У народов шиллук, занде и бари были более регулярные конфликты с соседними государствами.

Колонизация Османо-египетское завоевание при династии Мухаммеда Али

К моменту начала колонизации Африки европейцами в Южном Судане имело место господство занде, однако не существовало организованных государственных образований. Арабам и туркам-османам в силу естественных географических барьеров также не удалось подчинить себе этот регион, благодаря чему южные суданцы избежали исламизации, сумев сохранить свои этнические и культурные особенности. Некоторый успех в сфере освоения южносуданских территорий наблюдался в 1820-х и 1870-х годах со стороны Египта, но окончательная их колонизация была осуществлена уже британцами.

В 1821 году султанат Сеннар на севере пал перед армией Египта во времена правления Мухаммеда Али. Затем турецко-египетские силы начали набег на юг после укрепления своего контроля над северными территориями Дарфура, Курдуфана и Фунджистана. В 1827 году Хуршид Ахмед-паша повёл войска через земли динка, а в 1830 году возглавил экспедицию к слиянию Белого Нила и Собата. Наиболее успешными миссиями руководил адмирал Салим Кабудан, который в период с 1839 по 1842 год плавал по Белому Нилу, добравшись до современной Джубы.

Турецко-египетские войска попытались создать форты и гарнизоны в регионе, но болезни и дезертирство вынудили их быстро отступить. Хотя на Египет претендовали османские хедивы, они не могли оказывать никакой реальной власти над регионом. В 1851 году под давлением иностранных держав правительство Египта открыло регион для европейских торговцев и миссионеров.

Европейцы обнаружили большой запас слоновой кости, также они обнаружили, что местные жители мало интересовались тем, что они продавали. В результате торговцы часто прибегали к силе, захватывая слоновую кость, но даже это оказалось неэкономичным, и торговые предприятия имели мало успеха. Христианские миссионеры также основывали свои миссии в регионе вместе с католическим апостольским викариатством Центральной Африки. Миссионеры оказали незначительное влияние на регион в начале XIX века.

Торговая империя Аль-Зубайра