BacDive (Bacterial Diversity Metadatabase) мета је база података бактерија која пружа информације о биодиверзитету бактерија и археја.
Опис BacDive је извор разних врста метаподатака, као што је таксономија, морфологија, физиологија, окружење и молекуларна биологија бактерија. Већина података се ручно обележава и одржава. Верзија од септембра 2015. пружала је информације за око 54.000 сојева. Базу података хостује Лајбницов институт DSMZ — Немачка колекција микроорганизама и ћелијских структура GmbH и припада de.NBI — Немачкој мрежи биоинформатичке инфраструктуре.
Садржај и одлике База података Септембра 2015. база података је имала 233 различита поља за унос података, подељена у категорије „Име и таксономска класификација”, „Морфологија и физиологија”, „Култура и услови раста”, „Изолација, узорци и информације о окружењу”, „Апликација и интеракција”, „Молекуларна биологија” и „Доступност соја”. База података је имала око 300.000 уноса, повезаних са одговарајућим сојем и референцом. Подаци се преузимају из унутрашњих описа збирки култура бактерија, зборника које су саставили експерти и примарне научне литературе.
Приступ подацима Подацима се може приступити или преко GUI-ја или преко веб-сервиса RESTful. Користећи GUI кориснички интерфејс корисник може одабрати између једноставне претраге основних поља као што је таксономија или унос ID-а, или пак користити напредну претрагу у којој је омогућен преглед 35 поља за податке и комплексна претрага комбиновањем неколико поља. Подаци се могу преузети у формату PDF (за поједине сојеве) или CSV формати за веће сетове података (за вишеструке сојеве). Преко веб-сервисног портала доступан је не само садржај сајта BacDive већ и референтна листа Prokaryotic Nomenclature Up-To-Date.
Остале базе података За податке који су ван фокуса сајта BacDive, пружене су везе до других база података на којима је могуће пронаћи повезане податке о сојевима: SILVA BRENDA PANGAEA Straininfo.net GBIF EBI NCBI
Референце
Спољашње везе Једноставна претрага на BacDive Напредна претрага на BacDive Веб-сервис BacDive
Категорија:Биолошке базе података Категорија:Метаподаци