Stora Mörtsjön kan syfta på ett antal insjöar i Sverige:
Stora Mörtsjön, Småland, sjö i Oskarshamns kommun, (15,6 ha) Stora Mörtsjön, Södermanland, sjö i Gnesta kommun, Stora Mörtsjön, Dalarna, sjö i Falu kommun, (12,1 ha) Stora Mörtsjön (Ockelbo socken, Gästrikland), sjö i Ockelbo kommun, Stora Mörtsjön (Ovansjö socken, Gästrikland), sjö i Sandvikens kommun, (1,4 ha) Stora Mörtsjön (Järvsö socken, Hälsingland), sjö i Ljusdals kommun, (17,6 ha) Stora Mörtsjön (Los socken, Hälsingland), sjö i Ljusdals kommun, (15,9 ha)
Se även Mörtsjön
Kategori:Listor över Sveriges insjöar baserat på namn