Stora Skärsjön kan syfta på ett antal insjöar i Sverige:
Stora Skärsjön (Tönnersjö socken, Halland), sjö i Halmstads kommun, (33 ha) Stora Skärsjön (Ullareds socken, Halland), sjö i Falkenbergs kommun, (33,5 ha) Stora Skärsjön (Valinge socken, Halland), sjö i Varbergs kommun, Stora Skärsjön (Aneboda socken, Småland), sjö i Sävsjö kommun och Växjö kommun, (27,6 ha) Stora Skärsjön (Sjösås socken, Småland), sjö i Växjö kommun, (70,7 ha) Stora Skärsjön, Västergötland, sjö i Tranemo kommun, Stora Skärsjön, Östergötland, sjö i Ydre kommun, (39,5 ha) Stora Skärsjön, Hälsingland, sjö i Hudiksvalls kommun, (19 ha)
Se även Skärsjön
Kategori:Listor över Sveriges insjöar baserat på namn