Hedvig Eleonora kyrka kan syfta på:

Hedvig Eleonora kyrka, Karlskrona – Karlskrona stadsförsamling i Lunds stifts första kyrkobyggnad, som revs under 1750-talet Hedvig Eleonora kyrka, Stockholm – en kyrkobyggnad i Hedvig Eleonora församling i Stockholms stift Hedvig Eleonora kyrka – en kyrka i Torneå, Finland, se Torneå kyrka