Heinrich Müller kan syfta på bland andra:
* Heinrich Müller (teolog) (1631–1675), tysk präst Heinrich Müller (anatom) (1820–1864), tysk anatom med ögat som specialitet Heinrich Müller-Breslau (1851–1925), tysk civilingenjör och professor Heinrich Müller (Gestapo) (1900–1945), tysk Gestapo-chef Heinrich Müller (fotbollsspelare, född 1889) (1889–1957), schweizisk fotbollsspelare och -tränare Heinrich Müller (fotbollsspelare, född 1909) (1909–2000), österrikisk fotbollsspelare och -tränare
Se även Heiner Müller (1929–1995), tysk dramatiker