miniatyr|Länder med bekräftade fall av Variant B.1.1.7. Kartan visar inaktuell data från och med 23 januari 2021.
Sars-cov-2 alfa, Variant B.1.1.7, även kallad f20I/501Y.V1, Variant of Concern 202012/01 (VOC-202012/01), alfavarianten, eller den brittiska virusvarianten är en variant av sars-cov-2, viruset som orsakar Covid-19. Varianten upptäcktes i Storbritannien i mitten av november 2020, när ett virusprov från september sekvenserades. Varianten korrelerar med den betydande ökningen av bekräftade fall av Covid-19 i Storbritannien och resterande Europa. Denna ökning tros delvis bero på aminosyrasubstitutionen N501Y i spikeproteinets receptor-bindande domän som behövs för att bindas till ACE2 på människans celler.
Nomenklatur Varianten har fått namnet B.1.1.7, och Variant of Concern 202012/01 (VOC-202012/01). Varianten hade tidigare också kallats för the first Variant Under Investigation in December 2020 (VUI – 202012/01) av Public Health England, men bytte senare namn till Variant of Concern (VOC-202012/01) den 21 december 2020. Tidiga rapporter benämnde varianten som UK COVID-19 variant, och UK Coronavirus variant.
Den 31 maj offentliggjorde Världshälsoorganisationen ett nytt system, baserat på det grekiska alfabetet, för att namnge varianter av SARS-CoV-2. Syftet var att förenkla kommunikation till allmänheten, samt att undvika stigmatiserande namn utifrån var varianter först upptäcktes. I det nya systemet har B.1.1.7 fått beteckningen alfa.
I Sverige har varianten kallats för den brittiska virusvarianten, och den brittiska virusmutationen.
Spridningsutveckling av alfa-varianten +Spridning av alfa-varianten (analyserade positiva test för sars-cov-2 under angiven vecka)LandTest20202021 Vecka 42 Vecka 43 Vecka 44 Vecka 45 Vecka 46 Vecka 47 Vecka 48 Vecka 49 Vecka 50 Vecka 51 Vecka 52 Vecka 53 Vecka 1 Vecka 2 Vecka 3 Vecka 4 Vecka 5 Vecka 6 Vecka 7 Vecka 8 Vecka 9 Vecka 10 StorbritannienSek.0,05%0,35%1,0%2,7%6,3%10,2%10,2%13,9%32,9%45,7%51,3%70,6%74,1%78,6%86,0%89,1%–––––– England*Sek.% Sek.
rådata
modell0,07% (0,02%) (N/A) (N/A)0,4% (0,5%) (N/A) (N/A)1,0% (1,2%) (N/A) (N/A)3,2% (1,5%) (N/A) (N/A)5,7% (5,3%) (N/A) (N/A)10,0% (7,8%) (15,2%) (m:13,3%)19,7% (11,4%) (24,3%) (m:15,9%)34,4% (22,1%) (36,8%) (m:22,0%)51,8% (38,1%) (49,3%) (m:32,1%)63,7% (61,8%) (60,7%) (m:57,2%)72,4% (62,1%) (72,1%) (m:68,9%)77,9% (78,4%) (75,0%) (m:74,0%)82,1% (76,7%) (80,7%) (m:78,3%)87,5% (79,7%) (83,3%) (m:82,1%)90,6% (–) (88,2%) (m:86,0%)93,8% (–) (87,5%) (m:89,3%)95,7% (–) (93,4%) (m:92,5%)97,4% (–) (95,3%) (m:94,6%)98,1% (–) (97,0%) (m:95,2%)98,6% (–) (95,6%) (m:94,7%)98,7% (–) (92,9%) (m:93,7%)– (–) (96,1%) (m:94,1%) Nordirland Saknas data Saknas data Saknas data Saknas data Saknas data17,9%7,4%37,5%23,0%50,0%25,0%58,8%45,2%71,4%77,8%72,4%95,7%88,9%92,2%100,0 (m:91,0%)85,9%
(m:87,9%)100,0%
(m:91,1%) Skottland Saknas data Saknas data Saknas data Saknas data Saknas data9,5%9,7%10,4%11,7%51,4%40,0%35,8%62,1%67,2%62,5%69,2%70,6%93,9%82,0%100,0% (m:92,1%)91,1% (m:92,7%)100,0% (m:96,9%) Wales Saknas data Saknas data Saknas data Saknas data Saknas data27,9%8,3%10,7%26,3%13,4%15,9%19,8%54,4%61,5%69,0%68,1%77,0%69,4%82,8%87,9% (m:79,7%)77,2%
(m:79,5%)69,9%
(m:73,3%)Utanför Storbritannien BelgienSek.– –– –– –– –– –– –– –0,0% <5%0,0% <5%0,0% <5%13,6% <5%0,0% <5%7,1% (7,2%)7,7% (6,9%)13,4% (16,6%)23,4% (19,5%)40,0% (22,4%)42,7% (27,9%)50,8% (34,4%)58,0% (45,8%)58,9% (46,3%)79,3% (54,8%) BulgarienSek.–––––––––––––––52,1%–70,8%––73,4%– DanmarkSek.––––0,3%0,2%0,4%0,4%0,4%0,9%1,8%2,0%3,7%7,1%12,8%19,5%29,7%47,1%65,8%76,5%85,1%92,7% FrankrikeRT-PCR proxy utan sek. Sek.
*Sek.%– –
–– –
–– –
–– –
–– –
–– –
–– –
–– –
–– –
–– –
–– –
–– –
–– –
(3,3%)– –
–– –
–– –
(13,2%)– –
–36,1% –
–49,3% (39,5%)
(39,1%)59,5%
(49,5%)
–65,8%
–
–– Irland–––1,9% (för lite data)0,0% (för lite data)0,0% (för lite data)6,1% (för lite data)2,2% (för lite data)1,6% (för lite data)7,5%16,3%26,2%46,3%57,7%69,5%75,0%90,1%88,6%~92%––– Israel v.51+1 Sek. efter v.1–––––––––3-4%––10-20%10-20%30-40%40-50%~70%~80%~90%––– ItalienSek.%––––––––––––––––17,8%–54,0%––– LuxemburgSek.–––––––––0,3%0,9%4,2%8,8%15,5%17,0%36,2%53,0%54,1%53,8%65,5%62,8%– NederländernaSek.–––––––1,3%0,8%0,5%2,1%4,4%9,6%15,9%23,5%24,7%31,0%40,1%64,3%75,2%82,0%– NorgePCR proxy och sek. Sek.–––––0,0% –2,0% –0,0% (0,0%)4,9% (0,0%)8,9% (7,2%)6,0% (2,9%)14,9% (1,3%)18,9% (5,7%)19,5% (11,6%)15,2% (9,3%)19,8% (20,1%)34,1% (30,3%)43,6% (40,8%)60,0% (58,4%)71,8% (65,0%)76,7%
–72,7%
– PortugalSGTFL*Sek.%–––––––1,7%0,8%1,2%1,7%2,9%6,8%12,3%22,7%33,5%39,2%40,9%45,7%50,5%56,0%64,3% SchweizSek.–––––––––0,04%0,4%0,8%2,6%4,9%9,2%16,5%26,0%30,4%39,7%58,7%71,1%– SverigeSek. alla N501Y+A570D pos. tester–––––––––––––––10,8% (5 av 21 regioner)15,1% (5 av 21 regioner)27,3% (5 av 21 regioner)30,4% (19 av 21 regioner)41,5% (19 av 21 regioner)56,4% (19 av 21 regioner)71,3% (19 av 21 regioner) TysklandPCR proxy och Sek. Sek.– –– –– –– –– –– –– –– –– –– –– –– –– (2,7%)2,0% (9,3%)3,6% (5,0%)4,7% (10,9%)7,2% (18,0%)17,6% (20,9%)25,9% (33,0%)40,0% (41,5%)54,5%
–63,5% – ÖsterrikePCR (N501Y)*Sek.%––––––––––––7,6%18,7%15,1%22,5%28,5%23,1%34,3%61,6%63,2%48,3% (73,7%)Nordamerika USA*Sek.%–––––––––0,05%0,2%0,4%0,5%1,0%1,7%2,9%4,5%7,8%12,2%19,0%26,2% Kalifornien, USA*Sek.%–––––––––0,3%0,3%0,7%1,1%1,3%1,9%1,9%3,1%5,2%12,8%16,6%18,5% Florida, USA*Sek.%–––––––––0,2%0,5%0,9%1,0%2,3%4,5%8,1%10,7%14,3%20,9%28,2%37,4%Andra länder som inte rapporterar data varje vecka men har mer än 5% av varianten: Slovakien (72%), Malta (61%), Spanien (25-30%), och Polen (9%).Fetmarkerad text innebär att varianten står för mer än 50% av alla bekräftade fall i regionen under den specifika veckan Följande länder rapporterar inte hur många fall av varianten som har upptäckts men tros med stor sannolikhet ha en stor andel då de sekvenserat mer än 50 fall av varianten genom helgenomsekvenseringar.
Turkiet (486 fall) Kanada (317 fall) Finland (268 fall) Australien (140 fall) Kroatien (121 fall) Nigeria (113 fall) Sydkorea (90 fall) Slovenien (87 fall) Japan (86 fall) Litauen (83 fall) Indien (81 fall) Rumänien (76 fall) Ghana (67 fall) Singapore (66 fall) Nya Zeeland (63 fall) Nordmakedonien (53 fall) Brasilien (53 fall) GISAID-databasen innehåller alla sekvenserade COVID-19-genom.
Upptäckt De två första genuppsättningarna som tillhör varianten B.1.1.7 samlades in den 20 september 2020 i Kent och ytterligare ett den 21 september 2020 i London.
Smittspårning har visat att denna variant framträdde i september 2020, och förekom i mitten av november i små mängder. Första gången som denna variant kunde kopplas till ökningen av fall var i slutet av november när Public Health England utredde varför smittan inte sjönk i Kent, trots nationella restriktioner. PHE upptäckte ett kluster som spreds in i London och Essex som senare kunde kopplas till variant B.1.1.7.
Även om varianten först upptäcktes i Kent är det inte fastställt var den har sitt ursprung. En teori spekulerar om att versionen kan ha uppkommit hos en kronisk sjuk person med nedsatt immunförsvar vilket kan ha gett viruset en lång tid att föröka sig och mutera.
Egenskaper
Genetik Mutationer är vanligt förekommande hos sars-cov-2. Närmare 4000 mutationer har påvisats i virusets spikeprotein, enligt COG-UK. Fokus på mutationer är ett vanligt sätt att spåra spridningen av viruset. Det visar också att SARS-CoV-2 kom till Storbritannien i över 1000 enskilda fall och det visar att en variant med mutation G614 har helt ersatt den tidigare mutationen D614.
Variant B.1.1.7 har23 mutationer: 13 icke-synonyma mutationer, 4 deletioner och 6 synonyma mutationer, alltså 17 mutationer som förändrar proteinet och sex som inte gör det.
Effekt på vacciners effektivitet Sedan den 20 december 2020 var bilden från Public Health England att misstankar om att mutationen skulle vara resistens mot Pfizer-BioNTechs vaccin, som för närvarande används i Storbritanniens vaccinprogram, saknade ordentligt underlag. Deras uppfattning är att människor fortfarande kommer skyddas mot covid-19 med vaccinet.
Dödlighet Studier talar för att infektion av B.1.1.7 är förenat med högre dödlighet än infektion av den vanliga sars-cov-2. En fall-kontrollstudie där man jämfört patienter som testat positivt för B.1.1.7 med jämförbara patienter med annan sars-cov-2, har visat en 64% högre dödlighet inom 28 dagar från provtagning för patienterna med B.1.1.7.
E484K mutation Den 2 februari 2021 rapporterade Public Health England att de hade upptäckt "ett begränsat antal B.1.1.7 VOC-202012/01 genom med E484K mutationer", vilken kan återfinnas hos både den sydafrikanska och brasilianska varianterna av SARS-CoV-2; en mutation som kan försämra vaccinens effektivitet, en studie visar att vaccinkandidaterna från Novavax och Johnson & Johnson verkar vara mindre effektivt på grund av E484K. Den 9 februari 2021 blev det känt att runt 76 fall med mutationen E484K upptäckts, flest i Bristol men också i Liverpool. En vecka senare uppmärksammades i en rapport från PHE att det upptäckts 77 bekräftade och sannolika fall av mutationen runt i Storbritannien, i två olika varianter av sars-cov-2: VUI-202102/01 och VOC-202102/02. Den sistnämnda är numera känd som "B.1.1.7 med E484K".
Den 5 mars 2021 kom nyheten att variant B.1.1.7 med E484K-mutationen upptäckts hos två patienter i USA (Oregon och New York). Forskare tror att E484K-mutationen i Oregon har uppstått spontant.
Spridning
Norden
Danmark
November - December 2020 Inledningsvis enligt Statens seruminstitut (SSI) skulle endast nio danskar smittats med alfa-varianten av coronaviruset och dessa nio bekräftades mellan den 14 november och 3 december: sex i Storköpenhamn och tre på Nordjylland.
Danmark bekräftade ytterligare 33 nya smittfall den 23 december 2020. enligt ett dokument från SSI. Dokumentet visar att proverna togs mellan den 14 november till 14 december. Danmark sekvenserar prover mycket snabbare och i högre utsträckning än vad andra länder gör och därför var det endast en tidsfråga innan andra länder också skulle upptäcka den nya varianten.
Januari 2021 I den första veckan av januari stod den brittiska varianten för ungefär 4% av alla analyserade prover och ökade till 45% i den andra veckan i februari (vecka 6).
Februari 2021 Under februari 2021 dominerade alfavarianten i Danmark, och stod för närmare 60 % av alla analyserade prover. Enligt en dansk studie från den 24 februari 2021 tros varianten medföra en 64 % högre risk för sjukhusinläggning.
Norge
December 2020 Under vecka 50-53 2020 sjönk andelen alfa-smitta från 7,2 % till 1,3 %, vilket i efterhand tros varit ett felaktigt resultat eftersom provstorleken var liten och testningen endast var riktad mot resenärer från Storbritannien.
Januari 2021 Varianten ökade sedan från 7,6 % under första veckan av januari till 38,2 % i vecka 6, i alla genomsekvenserade tester.
Februari 2021 Under vecka 6 kunde Folkehelseinstitutet visa att den verkliga siffran istället låg på runt 20-30 % i befolkningen, när man bortser från alla resenärer som testat positivt. Varianten hade sin största spridning i Oslo och Viken, där man såg att varianten gick från 18 % av alla sekvenserade prover till 90 % av analyserade prover i Oslo mellan den 20 januari till 23 februari och en ökning från 20 % till 80 % av analyserade prover i Viken från den 25 januari till den 23 februari.
Sverige December 2020 Den 19 december hade Folkhälsomyndigheten inte bekräftat några fall av den nya varianten av viruset i Sverige, men det gick inte att dra någon säker slutsats huruvida viruset förekom i Sverige. Dagen efter gick Folkhälsomyndigheten ut och sa att "den nya varianten kan vara mer smittsam, men inget tyder på att den skulle ge svårare sjukdom. Varianten har hittills inte hittats i Sverige."