Generalsjömilitiekontoret var ett svenskt kollegialt ämbetsverk under perioden 1791-1794, vilket fungerade som överstyrelse för flottan i militärt och ekonomiskt hänseende.
Generalsjömilitiekontoret övertog Amiralitetskollegiums uppgifter och efterträddes av Storamiralsämbetena för örlogsflottan respektive arméns flotta. Verksamheten var lokaliserad till Sparreska palatset (hus nummer 11) på Riddarholmen i Stockholm.
Chefer 1791-1792 Carl Olof Cronstedt, statssekreterare för Sjöärendena 1792-1794 Carl August Ehrensvärd
Källor Svenska marinens högre chefer 1700-2005, Rune Kjellander, Probus förlag, Stockholm 2007 (), sid 186 Svensk rikskalender 1908, sid 66
Kategori:Svenska marinen Kategori:Ej längre existerande svenska statliga militära myndigheter Kategori:Riddarholmen Kategori:Organisationer bildade 1791 Kategori:Organisationer upplösta 1794