Перший Перелік регіонально рідкісних видів тварин для Харківської області був затверджений рішенням Харківської обласної ради від 25 вересня 2001 р.
У 2012 році за ініціативи вчених Харківського національного університету ім. Каразіна був складений новий «Перелік видів тварин, які підлягають особливій охороні на території Харківської області» з огляду на останнє видання Червоної книги України (2009 р.), міжнародні переліки рідкісних тварин (МСОП, Європейські червоні списки, Додатки до Боннської, Бернської та Вашингтонської конвенцій, тощо) та зміни, що відбулися у фауні регіону. До регіонального «Переліку» були включені ті види тварин, які постійно або тимчасово перебувають у природних умовах на території Харківської області та занесені до Червоної книги України, не занесені до Червоної книги України, але є рідкісними для Харківської області або перебувають під загрозою зникнення, занесені до Червоного списку Міжнародного союзу охорони природи, Європейського червоного списку, а також ті, що підпадають під дію міжнародних конвенцій, ратифікованих Україною. У порівнянні з попередніми подібними переліками, з «Переліку» 2012 року було виведено види, що наразі відсутні на території області або, за даними ретельних обліків, можуть вважатися такими, що не перебувають під загрозою зникнення. Водночас, до «Переліку» додано низку нових об'єктів фауни Харківщини, відомості про які було отримано у ході спеціальних досліджень.
У лютому 2013 року на підставі нового «Переліку видів тварин, які підлягають особливій охороні на території Харківської області» була видана «Червона книга Харківської області. Тваринний світ». Координацію робіт щодо підготовки цього видання здійснювала обласна комісія з питань Червоної книги та Державне управління охорони навколишнього природного середовища у Харківській області.
До Червоної книги Харківщини занесено 386 видів тварин ― представників класів: звичайні губки (2 види), покритороті (3 види), гідроїдні (2 види), п'явки (4 види), двостулкові (3 види), черевоногі (10 видів), зяброногі раки (8 видів), щелепоногі (3 види), павукоподібні (6 видів), губоногі (1 вид), комахи (199 видів), непарноніздрьові (1 вид), променепері риби (18 видів), амфібії (5 видів), рептилії (10 видів), птахи (75 видів), ссавці (36 видів).
Червона книга Харківської області Види тварин наведені в таблицях у послідовності, в якій вони представлені у виданні «Червона книга Харківської області. Тваринний світ» (2013 р.).
Губки, мохуватки, жалкі, кільчасті черви Вид, включений до Червоної книги України (2009 р.)
№з/п Вид Охоронні категорії Родина Ряд Клас Тип зображення українськаназва біноміальнаназва ЧКХО ЧКУ МСОП /ЄС / БЕ 1. Бодяга ставкова ВР - БодяговіSpongillidae ГаплосклериHaplosclerida Звичайні губкиDemo-spongiae ГубкиPorifera↓ 2. Бодяга річкова ВР - 3. Мохуватка гребінчаста ВР - Cristatellidae Plumatellida ПокриторотіPhylacto-laemata МохуваткиBryozoa ↑ ↓ 4. Мохуватка клубчаста ВР - Plumatellidae 5. Мохуватка повзуча ВР - 6. Гідра довгостебла ВР - ГідрідиHydridae АнтомедузиAntho-medusae ГідроїдніHydrozoa ЖалкіCnidaria↑ ↓ 7. Гідра зелена Синонім. ВР - 8. зображення П'явунка черепашача ВР - Плоскі п'явкиGlossi-phoniidae Хоботні п'явкиRhynchob-dellida П'явкиHirudinida Кільчасті червиAnnelida↓ 9. зображення Псевдотрохета п'ятикільчаста РД ВР - Глоткові п'явкиErpobdellidae Безхоботні п'явкиArhynchob-dellida 10. П'явка медична РД ВР ЄС IБЕ 3 Медичні п'явкиHirudinidae 11. П'явка аптечна РД ВР -
М'якуни
Тип: М'якуни Mollusca ↑ №з/п Вид Охоронні категорії Родина Ряд Клас зображення українськаназва біноміальнаназва ЧКХО ЧКУ МСОП ЄС /БЕ 12. РД ПерлівцевіUnionidae УніоноідиUnionoida ДвостулковіBivalvia↓ 13. Перлівниця товста РД 14. РД КульковіSphaeriidae 15. Лунка річкова РД ЛункиNeritidae НеритоїдиNeritoida ЧеревоногіGastropoda↑ ↓ 16. ВРР ДернівкиValloniidae Стебель-чатоокіStylom-matophora 17. зображення РД АгатівкиCochlicopidae 18. (завиток широкий) РД - ЗавитковіVertiginidae 19. Вертиго вузький ВРР 20. ВРР - Трунка-телінідиTrunca-tellinidae ЧеревоногіGastropoda↑ 21. ВРР - ВеретенівкиClausiliidae 22. НВМ - 23. ВРР - СклівкиZonitidae 24. РД -
Зяброногі раки, щелепоногі, павукоподібні, губоногі Вид, включений до Червоної книги України (2009 р.)
Тип: Членистоногі Arthropoda ↑ № з/п Вид Охоронні категорії Родина Ряд Клас зображення українськаназва біноміальнаназва ЧКХО ЧКУ МСОП /ЄС 25. Танімастикс ставковий ВР ВР - БранхіподидиBranchipodidae ЗяброногиAnostraca Зяброногі ракиBranchiopoda↓ 26. зображення Дрепанозурус дволикий ВР ВР - ХіроцефалідиChirocephalidae 27. зображення Хіроцефал Жадіна ВР - 28. зображення Стрептоцефал грізнорогий ВР - 29. ВР - ЩитніTriopsidae ЩитніNotostraca 30. Щитень літній ВР - 31. зображення ВР - ЛінцеідиLynceidae ДиплостракиDiplostraca 32. зображення Цизикус чотиривусий ВР - ЦизицидиCyzicidae 33. зображення Гемідіаптом Рилова ЗК ЗК - ДіаптомидиDiaptomidae КаланоїдиCalanoida ЩелепоногіMaxillopoda↑ ↓ 34. Гемідіаптом угорський ЗК - 35. зображення Гмеліна маленька ВР ВР - БокоплавовіGammaridae БокоплавиAmphipoda 36. Ерезус чорний РД - ЕрезідиEresidae ПавукиAraneae ПавукоподібніArachnida↑ ↓ 37. Мустелікоза половинчаста РД - Павуки-вовкиLycosidae 38. РД - ГнафозідиGnaphosidae 39. зображення РД - 40. Кзістікус монгольський РД - Павуки-крабиThomisidae 41. зображення Іленус прикрашений РД - Павуки-скакуниSalticidae 42. Мухоловка звичайна РД РД - СкутигериScutigeridae СкутигериScutigeromorpha ГубоногіChilopoda
Комахи Вид, включений до Червоної книги України (2009 р.) Вид, включений до першого Переліку регіонально рідкісних видів для Харківської області (2001 р.)