Вищим органом Співдружності Незалежних Держав є Рада глав держав СНД, у якій представлені всі держави-члени і яка обговорює і вирішує принципові питання, пов'язані з діяльністю організації. Рада глав держав збирається на засідання двічі на рік. Рада глав урядів СНД координує співпрацю органів виконавчої влади держав-членів в економічній, соціальній та інших областях спільних інтересів. Збирається чотири рази на рік. Всі рішення як в Раді глав держав, так і в Раді глав урядів, приймаються на основі консенсусу. Глави двох цих органів СНД головують по черзі в порядку російського алфавіту назв держав-членів Співдружності.
Список органів СНД
Антитерористичний центр держав - учасниць СНД Бюро по координації боротьби з організованою злочинністю та іншими небезпечними видами злочинів на території держав - учасниць СНД Виконавчий комітет СНД Комісія держав - учасниць СНД з використання атомної енергії в мирних цілях Комітет у справах воїнів-інтернаціоналістів при Раді глав урядів держав - учасниць Співдружності Консультативний комітет керівників правових служб міністерств закордонних справ держав - учасниць СНД Консультативна рада з підтримки і розвитку малого підприємництва в державах - учасницях СНД Консультативна Рада з праці, міграції та соціального захисту населення держав - учасниць СНД Консультативна рада керівників державних архівних служб держав - учасниць СНД Консультативна рада керівників органів державної (виконавчої) влади, що здійснюють управління державними матеріальними резервами в державах - учасницях СНД Координаційна транспортна нарада СНД Координаційна рада генеральних прокурорів держав - учасниць СНД Координаційна рада держав - учасниць СНД з інформатизації Координаційна рада Міжнародного союзу "Співдружність громадських організацій ветеранів (пенсіонерів) незалежних держав" Координаційна Рада Міжурядового фельд'єгерського зв'язку Координаційна рада з бухгалтерського обліку при Виконавчому комітеті СНД Координаційна рада керівників податкових служб держав - учасниць СНД Координаційна рада керівників органів податкових (фінансових) розслідувань держав - учасниць СНД Лізингова конфедерація (союз) СНД Міждержавна телерадіокомпанія "Мир" Міждержавний банк Міждержавний валютний комітет Міждержавна Координаційна Рада МТРК "Мир" Міждержавна координаційна рада з науково-технічної інформації Міждержавна координаційна рада керівників органів страхового нагляду держав - учасниць СНД Міждержавна рада "Радіонавігація" Міждержавна рада з антимонопольної політики Міждержавна рада з питань охорони промислової власності Міждержавна рада з виставково-ярмаркової та конгресної діяльності СНД Міждержавна рада з геодезії, картографії, кадастру та дистанційного зондування Землі Міждержавна рада з гідрометеорології СНД Міждержавна рада з космосу Міждержавна рада з промислової безпеки Міждержавна рада зі співробітництва в науково-технічній та інноваційній сферах Міждержавна рада зі співробітництва в області періодичної преси, книговидання, книгорозповсюдження та поліграфії Міждержавна рада зі стандартизації, метрології та сертифікації Міждержавна рада з надзвичайних ситуацій природного і техногенного характеру Міждержавна рада керівників вищих органів фінансового контролю держав - учасниць СНД Міждержавна рада керівників центральних органів виконавчої влади щодо співпраці в галузі машинобудування Міждержавний статистичний комітет СНД Міждержавний фонд гуманітарної співпраці держав - учасниць СНД Міждержавна екологічна рада Міжнародна академія виноградарства і виноробства Міжнародна асоціація бірж країн СНД (МАБ СНД) Міжнародний агропромисловий союз (Союзагро) Міжнародний союз громадських об'єднань "Союз добровільних товариств сприяння армії, авіації і флоту СНД" Міжпарламентська асамблея держав - учасниць СНД Міжурядова координаційна рада з питань насінництва СНД Міжурядова рада шляховиків Міжурядова рада з питань агропромислового комплексу СНД Міжурядова рада з лісопромислового комплексу та лісового господарства Міжурядова рада з нафти і газу Міжурядова рада з розвідки, використання та охорони надр Міжурядова рада зі співробітництва в галузі ветеринарії Міжурядова рада зі співробітництва в галузі хімії і нафтохімії Міжурядова рада зі співробітництва в будівельній діяльності Регіональна співдружність в галузі зв'язку Секція з міжбібліотечного абонемента держав - учасниць СНД Рада глав держав СНД Рада глав урядів СНД Рада командуючих Прикордонними військами Рада міністрів внутрішніх справ держав - учасниць СНД Рада міністрів закордонних справ СНД Рада міністрів оборони СНД Рада міністрів юстиції держав - учасниць СНД Рада з авіації та використання повітряного простору Рада з гуманітарного співробітництва держав - учасниць СНД Рада у справах молоді держав - учасниць СНД Рада із залізничного транспорту держав - учасниць Співдружності Рада з культурного співробітництва держав - учасниць СНД Рада з питань міжрегіонального і прикордонного співробітництва держав - учасниць СНД Рада зі співробітництва в галузі охорони здоров'я СНД Рада зі співробітництва в галузі освіти держав - учасниць СНД Рада з туризму держав - учасниць Угоди про співробітництво в галузі туризму Рада з питань фізичної культури і спорту учасниць Угоди про співробітництво в галузі фізичної культури і спорту держав - учасниць СНД Рада постійних повноважних представників держав - учасниць Співдружності при статутних та інших органах Співдружності Рада голів вищих арбітражних, господарських, економічних та інших судів, які вирішують спори в сфері економіки Рада керівників державних і громадських телерадіоорганізацій держав - учасниць СНД Рада керівників державних інформаційних агентств СНД (Інформсовет) Рада керівників державних органів з регулювання ринків цінних паперів держав - учасниць СНД Рада керівників міграційних органів держав - учасниць СНД Рада керівників органів безпеки і спеціальних служб держав - учасниць СНД Рада керівників статистичних служб держав - учасниць Співдружності Рада керівників митних служб держав - учасниць Співдружності Рада керівників торгово-промислових палат держав - учасниць СНД Спільна комісія держав - учасниць Угоди про співробітництво держав - учасниць СНД в боротьбі з незаконною міграцією від 6 березня 1998 року Спільна консультативна комісія з питань роззброєння Спільна робоча комісія держав - учасниць Угоди про співробітництво по припиненню правопорушень у сфері інтелектуальної власності Економічна рада СНД Економічний Суд СНД Електроенергетична Рада СНД
Див. також Алмазбе́к Шарше́нович Атамба́ев — Председатель Совета глав государств СНГ.
Література О. В. Задорожній. Міжпарламентська асамблея держав-учасниць СНД // Українська дипломатична енциклопедія: У 2-х т./Редкол.:Л. В. Губерський (голова) та ін. — К.:Знання України, 2004 — Т.2 — 812с. ISBN 966-316-045-4
Примітки