Хлорофлексія (Chloroflexia) — клас бактерій типу хлорофлексів (Chloroflexi), відомий як нитчасті зелені несірчані бактерії. Вони отримують енергію від світла і мають таку назву через зелений пігмент, який знаходиться у фотосинтезуючих тілах — хлоросомах .
Хлорофлексія, як правило, нитчаста і може рухатись за допомогою бактеріального ковзання . Вони факультативно аеробні, але не виробляють кисень у процесі отримання енергії від світла або фототрофії . Крім того, хлорофлексія має інший метод фототрофії (фотогетеротрофія), ніж справжні фотосинтетизуючі бактерії.
У той час як більшість бактерій, з точки зору різноманітності, є грамнегативними за виключенням Firmicutes, Actinobacteria і групи Deinococcus-Thermus. Члени типу Chloroflexi є грам позитивними.
Таксономія та молекулярні підписи Клас Chloroflexia є групою широко розгалужених видів фотосинтезуючих бактерій (за винятком видів Herpetosiphon і Kallotenue), які в даний час складаються з трьох порядків: Chloroflexales, Herpetosiphonales і Kallotenuales . Кожен Herpetosiphonales і Kallotenuales складається з одного роду в межах власного сімейства, Herpetosiphonaceae (Herpetosiphon) і Kallotenuaceae (Kallotenue) в той чаз, тоді як хлорофлексали більш філогенетично різноманітні.
Порівняльний геномний аналіз недавно уточнив таксономію класу Хлорофлексія, розділивши Хлорофлекси на підряд Chloroflexineae, що складаються з сімейств Oscillachloridaceae та Chloroflexaceae, та підряд Roseiflexineae, що містять сімейство Roseiflexaceae . Переглянута систематика ґрунтувалася на виявленні ряду збережених сигнатурних індексів (ЗСІ), які є надійними молекулярними маркерами спільного походження. Додатковим аргументом щодо поділу хлорофлексалів на два підряди є спостережувані відмінності у фізіологічних характеристиках, коли кожен підряд характеризується чіткими профілями каротиноїдів, хінонів та жирних кислот, які відсутні в іншому підряді.Hanada S, Pierson BK (2006) The Family Chloroflexaceae. In: The prokaryotes: a handbook on the biology of bacteria, pp. 815—842. Eds Dworkin M, Falkow S, Rosenberg E, Schleifer KH, Stackebrandt E Springer-: New York.Pierson BK, Castenholz RW (1992) The Family Chloroflexaceae. In: The prokaryotes, pp. 3754-3775. Eds Balows A, Truper HG, Dworkin M, Harder W, Schleifer KH Springer-: New York. Крім розмежування таксономічних рангів, ЗСІ можуть відігравати певну роль в унікальних характеристиках членів кладу. Зокрема, чотириаміно-кислотна вставка в білковий піруват флаводоксин / ферредоксин оксидоредуктаза, білок, який відіграє важливу роль у фотосинтетезуючих організмах, була виявлена серед усіх представників роду Chloroflexus і вважається, що вона відіграє важливу функціональну роль . Додаткова дослідження з використанням ЗСІ були проведені для розмежування філогенетичного положення хлорофлексії щодо сусідніх фотосинтетичних груп, таких як ціанобактерії. Види хлорофлексії проявляють чіткий зв'язок з видами хлоробі, їх найближчими філогенетичними родичами. Було встановлено, що ЗСІ є спільним серед членів хлорофлексії та хлоробі, що було трактовано як результат горизонтальної передачі гена між двома родичами.
Таксономія В даний час є прийнятою така таксономія:
Ряд Chloroflexales Підряд Chloroflexineae Родина Chloroflexaceae Trüper 1976 emend. Gupta et al. 2013 Рід Chloroflexus Pierson and Castenholz 1974 C. aggregans Hanada et al. 1995 C. aurantiacus Pierson and Castenholz 1974 Родина Oscillochloridaceae Keppen 2000 emend. Gupta et al. 2013 Рід Oscillochloris Gorlenko and Pivovarova 1989 emend. Keppen et al. 2000 O. chrysea Gorlenko and Pivovarova 1989 O. trichoides (ex Szafer) Gorlenko and Korotkov1989 emend. Keppen et al. 2000 Рід Chloronema Dubinina and Gorlenko 1975 Chloronema giganteum Dubinina and Gorlenko 1975 Підряд Roseiflexineae Родина Roseiflexaceae Gupta et al. 2013 Рід Roseiflexus Hanada et al. 2002 Roseiflexus castenholzii Hanada et al. 2002 Рід Heliothrix Pierson et al. 1986 Heliothrix oregonensis Pierson et al. 1986 Ряд «Herpetosiphonales» Родина «Herpetosiphonaceae» Рід Herpetosiphon Holt and Lewin 1968 H. aurantiacus Holt and Lewin 1968 H. geysericola (Copeland 1936) Lewin 1970
Крім того, «Kouleothrix aurantiaca» та «Dehalobium chlorocoercia» ще не були повністю описані.
Етимологія Назва «Chloroflexi» — неолатинова множина «Chloroflexus», яка є назвою першого описаного роду. Іменник — це поєднання грецького chloros (χλωρός) означає «зеленувато-жовтий» та латинського flexus (від flecto)Lewis, Charlton T. and Charles Short, A Latin Dictionary. Oxford: Clarendon Press, 1879. Online version at Perseus означає «зігнуте», що означає «зелений вигин». Назва не обумовлена хлором, елементом, відкритого у 1810 році сером Хамфрі Деві і названого так через блідо-зелений колір.
Примітки