20 września 1946 oboje zostali aresztowani przez władze komunistyczne (prawdopodobnie przyczyniło się do tego wykrycie awansu Alicji na stopień porucznika, przyznany przez władze podziemia niepodległościowego). Byli osadzeni w więzieniu na zamku w Rzeszowie. W marcu 1947, będąc w ósmym miesiącu ciąży, była sądzona przed Wojskowym Sądem Rejonowym w Rzeszowie pod przewodnictwem sędziego Jana Lubaczewskiego oraz przy udziale sędziego Norberta Ołyńskiego. Wyrokiem WSR w Rzeszowie z 27 marca 1947 została skazana na karę śmierci, utratę praw na zawsze oraz utratę mienia (w tymże procesie kobiet działających na rzecz Brygad Wywiadowczych Maria Grzegorczyk na karę dożywotniego pozbawienia wolności, a Irena Szajowska została skazana na karę 15 lat pozbawienia wolności). W dniu 22 kwietnia 1947 w celi śmierci w Rzeszowie urodziła syna Stanisława, bez niczyjej pomocy, po czym była pozostawiona w celi sama z noworodkiem. Cztery dni po porodzie otrzymała postanowienie Najwyższego Sądu Wojskowego z 21 kwietnia 1947 stwierdzające złagodzenie kary śmierci na karę dożywotniego pozbawienia wolności wraz z pozbawieniem praw publicznych na zawsze, które było motywowane byciem skazanej w ósmym miesiącu ciąży. 27 grudnia 1947 została skierowana wraz z synem do więzienia w Fordonie, a na miejscu oboje zostali rozłączeni.