Historia Powstanie Instytutu Zdrowia Publicznego Uniwersytetu Jagiellońskiego Collegium Medicum jest powiązane ze Szkołą Zdrowia Publicznego, która powstała w Krakowie w 1991 roku jako wspólna inicjatywa Akademii Medycznej i Uniwersytetu Jagiellońskiego. Była to pierwsza tego typu placówka w Polsce, założona z pomocą Ministerstwa Zdrowia i Opieki Społecznej oraz francuskich ekspertów zdrowia publicznego. Szkoła wzorowała się na francuskiej Ecole Nationale de Sante Publique.
Szkoła podejmowała działania edukacyjne mające na celu przygotowanie kadr menedżerskich dla polskiego systemu opieki zdrowotnej. Wprowadzono studia podyplomowe z zakresu zarządzania szpitalem i administracji publicznej, a także kursy dla inspektorów farmaceutycznych i podyplomowe studium promocji zdrowia.
W 1992 roku nawiązała współpracę z ASPHER (Association of Schools of Public Health in European Region) czyli Stowarzyszeniem Szkół Zdrowia Publicznego w Regionie Europejskim, a dwa lata później zorganizowała XVI konferencję ASPHER pt. Information Policy in Public Health. W 1995 roku szkoła otrzymała akredytację dla programów nauczania wydaną przez ASPHER.