Merkurij Czerniowce (ukr. Футбольний клуб «Меркурій» Чернівці, Futbolnyj Kłub "Merkurij" Czerniwci) – ukraiński klub piłkarski i futsalu, mający siedzibę w mieście Czerniowce. Od sezonu 2006/07 do 2012/13 występował w futsalowej Pierwszej Lidze UkrainyСуммарная таблица Первой лиги Украины (1993 - 2016).
Historia Chronologia nazw: 1998: KNTEU Czerniowce (ukr. «КНТЕУ» Чернівці) 2002: KNTEU-SKA Czerniowce (ukr. «КНТЕУ-СКА» Чернівці) 2003: Merkurij-CzTEI Czerniowce (ukr. «Меркурій-ЧТЕІ» Чернівці) 2008: Merkurij Czerniowce (ukr. «Меркурій» Чернівці)
Klub piłkarski KNTEU Czerniowce został założony w Czerniowcach w 1998 z inicjatywy profesora Wydziału Finansów Czerniowieckiego Instytutu Handlowo-Ekonomicznego KNTEU Anatolij Moskalow. W 1999 roku drużyna piłkarska zadebiutowała w mistrzostwach obwodu czerniowieckiego w piłce nożnej (druga grupa), gdzie zajął 3. miejsce i otrzymał prawo w przyszłym roku do występów w pierwszej lidze mistrzostw obwodu czerniowieckiego. W 2002 pod nazwą KNTEU-SKA Czerniowce zajął trzecie miejsce w obwodzie.
8 kwietnia 2003 roku klub zmienił nazwę na Merkurij-CzTEI Czerniowce.