Początkowo Jak-42 znajdował się około 2300 stóp nad ziemią. Okazało się to jednak za wysoko by bezpiecznie wylądować, wykonano więc procedurę odlotu po nieudanym podejściu (ang. missed approach procedure). Wkrótce potem załoga Lotu 110 przekazała przez radio, że nie odbiera sygnału nadawanego przez VOR (rodzaj radiolatarni stosowanej w lotnictwie, wykorzystującej pasmo radiowe 108–117,950 MHz). Kontrola ruchu lotniczego nie była w stanie spełnić prośby o podanie namiaru, a pilot lotu 110 poinformował, że nie widzi świateł drogi startowej. Wkrótce potem lot 110 rozbił się, zabijając 115 ze 116 osób na pokładzie. Jeden z pasażerów, Rade Jevremović, przeżył, ale został ciężko ranny.
Pasażerowie i załoga Osiemdziesiąt procent pasażerów było obywatelami Jugosławii, głównie etnicznymi Albańczykami. Pozostali byli obywatelami Macedonii. Czterech członków załogi było Rosjanami, a czterech członków personelu pokładowego było Macedończykami. Wśród pasażerów był między innymi Pierre Ollier, francuski Wysoki komisarz Narodów Zjednoczonych do spraw uchodźców (UNHCR), który właśnie wrócił z rozdartej wojną Bośni i Hercegowiny.