Podczas trzech kadencji w Zgromadzeniu Narodowym była rzeczniczką prasową Bułgarskiej Partii Socjalistycznej oraz wiceszefową bułgarskiej delegacji do Unii Międzyparlamentarnej.
Ambasador w Stanach Zjednoczonych Poptodorowa została mianowana na stanowisko Ambasadora w Stanach Zjednoczonych w 2002 roku i pełniła tę funkcję do 2008 roku. W trakcie jej kadencji Bułgaria została członkiem Sojuszu Północnoatlantyckiego (NATO) oraz Unii Europejskiej. W 2010 roku została ponownie mianowana na tę samą funkcję. 10 sierpnia 2010 roku przekazała listy uwierzytelniające na ręce Prezydenta Stanów Zjednoczonych Baracka Obamy.
Późniejsza kariera Poptodorowa jest wiceprezydentem oraz wiceprezydentem i dyrektorem w .
Życie prywatne Poptodorowa jest mężatką, ma jednego syna. Mówi płynnie w języku angielskim, włoskim, francuskim, rosyjskim i bułgarskim.
Oskarżenie o kradzież 24 lutego 2017 Elena Poptodorowa została zatrzymana przez ochronę na Lotnisku Chopina w Warszawie. Pracownik ochrony w jednej z lotniskowych drogerii zatrzymał ją pod zarzutem kradzieży kosmetyków o wartości ponad 1600 złotych. O zdarzeniu została poinformowana Ambasada Bułgarii w Warszawie.