25 października 1941 przybył na Stację Zborną w Buzułku i jako chory został skierowany do szpitala. 3 grudnia został wyznaczony na stanowisko referenta w Oddziale I Sztabu Dowództwa Polskich Sił Zbrojnych w ZSRR. 16 lutego 1942 został komendantem Komendy Uzupełnień Nr 5 9 Dywizji Piechoty, a 2 kwietnia dowódcą Oddziału Likwidacyjnego 9 DP w Margiełan. 6 maja został zastępcą dowódcy pułku specjalnego w Ośrodku Zapasowym w Guzar, lecz już 26 maja 1942 powierzono mu obowiązki komendanta Komendy Uzupełnień Nr 7 Ośrodka Zapasowego Armii. 23 maja 1943 został przydzielony do Szefostwa Administracji Rezerw Sztabu Armii Polskiej na Wschodzie na stanowisko kierownika referatu uzupełnień. 27 sierpnia tego roku został przeniesiony do Ośrodka Zapasowego Armii na stanowisko zastępcy komendanta.
31 marca 1946 został zwolniony z czynnej służby wojskowej i przeniesiony do rezerwy personalnej oficerów.
Zmarł 2 grudnia 1978. Został pochowany na Cmentarzu Świętej Rodziny we Wrocławiu. mały|Grób mjra Benedykta Serafina na Cmentarzu Świętej Rodziny Benedykt był żonaty z Zofią Łopuską (1907–1998), córką Zenona (ur. 1876), starosty łukowskiego, konstantynowskiego w Janowie Podlaskim i słupeckiego.