Procedura Etapy analizy +Podstawowe etapy analizy PCR/ASOKrokPCR/ASO forwardPCR/ASO reverse1.Reakcja PCR - amplifikacja próbki2.Osadzenie próbki na membranieOsadzenie sond na membranie3.Naniesienie znakowanych sondNaniesienie znakowanej próbki4.Odpłukanie słabiej związanych sondOdpłukanie słabiej związanej próbki5.Wizualizacja hybryd metodą właściwą dla sposobu znakowania6.Analiza wyników

Interpretacja wyników +Rozkład wyników dla poszczególnych układów alleliSonda komplementarna dla allelu dzikiegoSonda komplementarna dla allelu zmutowanegoHomozygota typu dzikiego + -Homozygota zmutowana - +Heterozygota + + + wynik pozytywny, czyli powstanie hybrydy,

- wynik negatywny, czyli brak hybrydy.

Wady i zalety PCR/ASO jest wydajną metodą do badań przesiewowych i rutynowych analiz - jest bardziej uniwersalną metodą wykrywania polimorfizmów typu SNP niż RFLP (w przypadku RFLP mutacja musi występować w obrębie sekwencji rozpoznawanej przez enzym restrykcyjny) oraz tańszą niż sekwencjonowanie, jakkolwiek trudności nastręcza optymalizacja analizy: