Muzeum Narodowe Filipin () – organizacja rządowa utworzona w 1998 roku, której podlegają muzea na Filipinach.
Historia W 1901 roku powstało Muzeum Etnologii, Historii Naturalnej i Handlu podlegające Departamentowi Oświaty. Od 1903 roku podlegało ono Wydziałowi Spraw Wewnętrznych i zostało przemianowane na Biuro Badań Etnologicznych. Przygotowało ono ekspozycję Filipin na wystawę światową w Luizjanie w 1904 roku. Po jej zakończeniu Biuro zlikwidowano i zmieniono nazwę na Muzeum Filipińskie.
Ustawą z 1933 roku podzielono Muzeum przenosząc Oddział Sztuk Pięknych i Historii do Biblioteki Narodowej, a Wydział Etnologii ze zbiorami z zakresu archeologii, etnografii i antropologii do Biura Nauki Wydziału Antropologii oraz z działu historii naturalnej Biura Nauki utworzono Oddział Muzeum Historii Narodowej, który od 1939 roku podlegał Sekretariatowi Rolnictwa i Handlu.
Podczas japońskiej okupacji Filipin w okresie II wojny światowej ponownie połączono oddziały w Muzeum Narodowe Filipin, ale instytucja straciła większość kolekcji. Podczas bitwy o Manilę dawny budynek parlamentarny w którym przechowywano zbiory został zniszczony przez amerykańską artylerię. Odbudowano go ze środków amerykańskich, co pozwoliło na ponowne otwarcie muzeum.