O działalności szkoły protestanckiej brak jest jednak informacji. Po 5 latach od przybycia do miasta Hojera został podpisany rozejm w Sztumskiej Wsi i Szwedzi w dniu 3 października 1635 roku opuścili Braniewo. Sam Hojer zwlekał jednak z wyjazdem, stąd w aktach miejskich pod datą 23 października znalazła się wzmianka, iż jako szkodliwy człowiek powinien zostać wypędzony z miasta. Opuściwszy Braniewo Hojer przeniósł się do Malborka, gdzie prawdopodobnie zmarł. W aktach miasto skrzętnie zanotowano, że żaden mieszkaniec Braniewa nie zmienił wiary na luteranizmTheodor Hirsch Geschichte des akademischen Gymnasiums in Danzig, in ihren Hauptzügen dargestellt, Gdańsk 1827, s. 24, 63–64.Joseph Bender Geschichte der philosophischen und theologischen Studien in Ermland : Festschrift des Koenigl. Lyceum Hosianum zu Braunsberg zu seiner fuenfzigjaehrigen Jubelfeier, sowie zur Erinnerung an das dreihundertjaehrige Bestehen der Hosianischen Anstalten ueberhaupt, Braunsberg : Gedruckt bei C. A. Heyne, 1868, s. 61..