Sezon 2021/22 – Era Simone Inzaghiego Po zaskakującym odejściu Antonio Conte w maju 2021 roku, nowym trenerem Interu został Simone Inzaghi. Pod jego wodzą nie tylko utrzymał miejsce w składzie, ale stał się jeszcze ważniejszym elementem drużyny.
Bastoni stworzył znakomite partnerstwo z lewym wahadłowym Federico Dimarco – duet, który przenieśli również na boiska reprezentacji Włoch. W styczniu 2022 roku Inter zdobył Superpuchar Włoch, pokonując Juventus 2:1 po dramatycznym golu Alexisa Sáncheza w doliczonym czasie gry.
Sam Bastoni wspominał to spotkanie: „W zeszłym sezonie zdobyliśmy Superpuchar po niezapomnianym meczu z Juventusem. To była twarda walka od pierwszej do ostatniej minuty. Gol Sáncheza był eksplozją radości, a świętowanie przed naszymi kibicami było wyjątkowym uczuciem".
Sezon zakończył się zdobyciem Pucharu Włoch, jednak w lidze Inter zajął drugie miejsce, przegrywając walkę o tytuł z AC Milan w dramatycznych okolicznościach ostatniej kolejki.
Sezon 2022/23 – Droga do finału Ligi Mistrzów Sezon 2022/23 przyniósł historyczny sukces w postaci awansu do finału Ligi Mistrzów – pierwszego dla Interu od 2010 roku.