Do jesieni 1933 roku okręt pozostawał na wodach chińskich. Od września 1933 roku do lutego 1934 roku przechodził modernizację w stoczni w Sasebo.
Po remoncie, 25 lutego 1934 roku „Yura” została okrętem flagowym 2. Flotylli Okrętów Podwodnych. Od października tego samego roku do stycznia 1935 roku, okręt przechodził kolejny remont, podczas którego poprawiono m.in. jego stateczność. W lutym 1935 roku okręt wraz z 2. Flotyllą wyruszył na Wyspy Kurylskie. Od 15 listopada 1935 roku do 1 grudnia 1936 roku okręt ponownie przebywał w rezerwie, przechodząc remonty. Do grudnia 1937 roku krążownik pełnił funkcję jednostki flagowej Sentai 8 i podczas wojny japońsko-chińskiej patrolował rejon Qingdao. W latach 1938–1939 okręt wraz z Sentai 8 operował na wodach chińskich. Od 1 maja 1940 roku „Yura” była okrętem flagowym 5. Flotylli Okrętów Podwodnych, operując w rejonie Karolinów, Wysp Marshalla i Marianów w miesiącach od maja do września.