Niewiele jest dostępnych narzędzi o wysokiej wydajności do genotypowania minisatelitów.

Metody genotypowania VNTR: adVNTR – wykorzystany do przewidywania zmienności w 2944 VNTR przecinających regiony kodujące VNTRseek – wykorzystuje program Tandem Repeats Finder (TRF) do wykrywania i charakteryzowania TRs wewnątrz odczytów, a następnie mapuje odczytane TRs do TRs w zestawie referencyjnym. Ponieważ VNTRseek buduje profile wzorców przed mapowaniem, jest odporny na obecność SNP i małych indeli>.

Zastosowanie VNTR Markery VNTR szybko okazały się użyteczne w medycynie, m.in.: do diagnostyki chorób genetycznych jako element badań medycyny sądowej metody opierające się na wykrywaniu polimorfizmu fragmentów restrykcyjnych zawierających tandemowe powtórzenia stały się narzędziem genetyki populacyjnej źródło markerów o potencjalnym zastosowaniu w analizie sprzężeń i konstruowaniu map genetycznych.

Przypisy 35px

Kategoria:Sekwencje nukleotydów Kategoria:Genetyka molekularna