Z czasem brak akceptacji tej nauki stawał się coraz wyraźniejszy, jak również coraz powszechniejszy na najwyższych szczeblach hierarchii kościelnej. W liście z 7 stycznia 1897 Joseph F. Smith, wówczas doradca w Pierwszym Prezydium, na polecenie prezydenta Wilforda Woodruffa napisał teoria Adama-Boga była osobistą opinią prezydenta Younga. Nie została też przedłożona radom kapłańskim Kościoła i jako taka nie jest wiążąca. Pierwsze Prezydium w 1912 oświadczyło, że wierni powinni czcić raczej Boga Ojca niż Adama. Cztery lata później oświadczono, że Jezus Chrystus jest tożsamy ze starotestamentalnym Jahwe, Bóg Ojciec zaś z Elohimem. Adama-Michała Archanioła pominięto, doprowadzając tym samym w istocie do odrzucenia teorii Adama-Boga jako części mormońskiego systemu wierzeń.
Teoria Adama-Boga w mormońskim dyskursie intelektualnym