Stangeria jest rodzajem siostrzanym względem rodzaju ceratozamia Ceratozamia, co potwierdziły badania molekularne nad DNA i kariologiczne.
Zagrożenia i ochrona Stangeria ma status gatunku narażonego (VU) na czerwonej liście publikowanej przez Międzynarodową Unię Ochrony Przyrody (IUCN). Zagrożona jest z powodu niszczenia siedlisk – zajmowania ich przez uprawy ananasa, trzciny cukrowej i bananów, tereny zabudowane oraz infrastrukturę drogową. Proces ten trwa od lat 60. XX wieku, nasilił się w końcu XX wieku. Na wielu obszarach, gdzie siedliska gatunku zostały silnie pofragmentowane, coraz wątlejsze populacje sukcesywnie zanikają.
Dodatkowym zagrożeniem dla gatunku jest jego pozyskiwanie z natury w związku z wykorzystaniem na potrzeby medycyny tradycyjnej i do uprawy jako rośliny ozdobnej. Tylko na dwóch targach specjalizujących się w tradycyjnych produktach leczniczych w Durbanie w lipcu 1992 roku sprzedano 3,4 tys. bulwiastych pędów stangerii, co w skali roku oznacza obrót ponad 40 tys. pędów. Dla ograniczenia ryzyka związanego z oferowaniem roślin wykopywanych z natury i wprowadzania ich do oferty handlowej gatunek ujęty jest w załączniku do Konwencji CITES.