Władze Zgodnie ze art. 8 statutu Uniwersytetu Rektor reprezentuje Uniwersytet we wszystkich czynnościach prawnych i nadzoruje całą jego działalność. Pełni on ogólne funkcje kierownicze, inicjatywne i koordynacyjne w zakresie działalności naukowej i dydaktycznej Uniwersytetu. Od 1 listopada 2017 funkcję tę pełni prof. Paolo Andrei. Jego kadencja zakończy się w 2023. Prof. Paolo Martelli pełni funkcję wicerektora, a prorektorami są: prof. Roberto Fornari (badania naukowe), prof. Sara Rainieri (dydaktyka i studenci) i prof. Fabrizio Storti (trzecia misja).
Kolejnymi strukturami istniejącymi na uniwersytecie są: Senat Akademicki (Senato Accademico) składający się z 10 członków z urzędu i 17 obieralnych (8 przedstawicieli personelu naukowego, 3 przedstawicieli personelu pomocniczego i 6 przedstawicieli studentów); Rada Administracyjna (Consiglio di Amministrazione) złożona z 10 członków; dyrektor generalny (Direttore Generale) wybierany na trzyletnią kadencję, obecnie (marzec 2022) jest nim adwokat Candeloro Bellantoni;.