Wtedy przeniosła się do Sucre y García Moreno do budynku wynajętego od Banku Centralnego (Banco Central).
9 sierpnia 1944 roku dekretem prezydenta powstała Casa de la Cultura Ecuatoriana (Dom Kultury Ekwadorskiej) w której skład weszła Biblioteka Narodowa. Gdy w 1983 roku oddano nowy budynek dla Domu Kultury przy 12 de octubre 555 y Patria, również zbiory Biblioteki zostały tam przeniesione.
Po uchwaleniu w 2016 roku Ley Orgánica de Cultura (LOC). Zgodnie z nim Biblioteka stoi na czele sieci bibliotecznej. Podlegają jej biblioteki szkolne, publiczne, uniwersyteckie i inne, niezależnie od właściciela. W związku z tym postanowiono przenieść Bibliotekę Narodową w nowe miejsce, pozostawiając w Domu Kultury Ekwadorskiej część zbiorów należących do jego biblioteki. Dość długo Biblioteka Narodowa nie miała swojej siedziby. Dyrektor Biblioteki María Augusta Vargas jeszcze w styczniu 2019 roku podała, że rozważane są różne opcje, z budową nowego budynku włącznie.
W 2019 roku podpisano umowę z Gminą Quito o przeniesieniu Biblioteki do trzech pawilonów Starego Szpitala Eugenio Espejo. Budynki wynajęto na 20 lat. Proces przenoszenia został zakłócony przez pandemię, ale we wrześniu 2020 roku rozpoczęła działalność w nowym budynku.