24 lutego 1660 został pozbawiony probostwa oraz stanowiska przełożonego zgromadzenia kanoników w kaliskich. Przeniósł się do opactwa w Trzemesznie i tam 10 czerwca 1673 zmarł i został pochowany.
Publikacje Stefan Damalewicz jest autorem Żywotów Biskupów kujawskich (1642 w drukarni Franciszka Cezarego w Krakowie), w których przedstawione są początki chrześcijaństwa w Polsce, rozległość diecezji kujawskiej, stan kościoła katedralnego, liczba kościołów parafialnych i klasztorów, zakres władzy biskupiej oraz początki zakonu krzyżackiego w Polsce.
Drugim dziełem wydanym w 1643 (w krakowskiej drukarni Walerego Piątkowskiego) jest spis chronologiczny proboszczów kujawskich. W 1655 wydał przejrzane i dostosowane do ustaw soboru trydenckiego ustawy dla kanoników regularnych. Jest również autorem Żywotu św. Bogumiła wydanym w Rzymie w 1661.