3 września 1935, po decyzji swoich rodziców, Sante rozpoczął okres próbny w klasztorze w Lonigo. Przez następne cztery lata uczył się w gimnazjum: nie brakowało mu dobrych chęci. 16 września 1939 został przyjęty do nowicjatu. W końcu złożył swoje świeckie ubranie, aby przywdziać habit i otrzymał nowe imię: Brat Kosma, na cześć świętego męczennika i lekarza. Następny rok spędził w klasztorze San Pancrazio w Barbarano, po czym 17 września 1940 r. złożył pierwszą profesję zakonną. Wraz z innymi braćmi uczniami musiał kilkakrotnie zmieniać siedzibę z powodu II wojny światowej: po piątej klasie gimnazjalnej, którą odbył w klasztorze św. Antoniego Padewskiego w Gemona del Friuli, przez pierwsze dwa lata szkoły średniej uczęszczał do klasztoru w Padwie, San Francesco Grande, a trzeci i ostatni rok nauki odbywał w klasztorze San Bernardino w Weronie.