W 1631 był kandydatem na stanowisko proboszcza w Królewcu, gdyż władze tego miasta poszukiwały na urząd osoby dającej gwarancję spokoju, a rada miasta Elbląga wystawiła księdzu Schambogenowi dobrą opinię. Jednak objęcie tego stanowiska nie doszło do skutku. Ks. Schambogen powrócił już na stałe do Fromborka. W 1637 roku otrzymał prowizję papieską na godność prałata-kantora kapituły warmińskiej. W 1643 z ramienia kapituły został administratorem komornictwa pieniężnieńskiego. W 1644 roku brał udział w wyborze następnego biskupa warmińskiego – Wacława Leszczyńskiego. Wkrótce potem ksiądz zaczął chorować i podupadać na zdrowiu.
Zmarł 17 grudnia 1648 roku. Pochowany został w katedrze we Fromborku, płyta nagrobna znajduje się przy drugim filarze nawy południowejKlerycy z ziem polskich, litewskich i pruskich święceni w Rzymie (XVI – pocz. XX w.) Clerici ex terris Poloniae, Lithuaniae et Prussiae Romae seu Urbe ordinati (saec. XVI ad init. XX) opracował Stanisław Jujeczka na podstawie kwerendy rzymskiej wykonanej wspólnie z ks. Henrykiem Gerlicem Wrocław 2018Mieczysław Józefczyk Elbląskie duchowieństwo katolickie na tle dziejów miasta 1246–1945, s. 131–135.