W 1990 na Uniwersytecie Jagiellońskim uzyskał habilitację na podstawie rozprawy Polski Leonidas. Rzecz o legendzie historycznej i literackiej generała Józefa Sowińskiego. W tym samym roku uzyskał stanowisko docenta, a w 1991 uzyskał stanowisko profesora nadzwyczajnego WSP w Rzeszowie. Od 1991 aż do przejścia na emeryturę w 2005 był kierownikiem Zakładu Literatury Romantyzmu i Pozytywizmu Instytutu Filologii Polskiej Wyższej Szkoły Pedagogicznej w Rzeszowie. W 1998 uzyskał tytuł naukowy profesora i stanowisko profesora zwyczajnego WSP w Rzeszowie (od 2001 Uniwersytet Rzeszowski).
W pracy badawczej Czesław Kłak zajął się literaturą polską XIX wieku, w tym szczególnie powieścią historyczną oraz legendą powstania listopadowego w historiografii i literaturze. Interesował się epistolografią i działalnością naukową Stanisława Pigonia; koordynował sprowadzenie do Rzeszowa jego księgozbioru. Opublikował kilka autorskich książek monograficznych i był redaktorem kilku kolejnych wydawnictw zbiorowych. W 1968 opublikował rozprawę Teoretyczne problemy powieści biograficznej.