Jej umiejętności zostały docenione i otrzymała stopnie Bachelier ès-Sciences i Bachelier ès-Lettres.
Kariera i dalsze losy W 1872 wyszła za swojego kuzyna, znanego naukowca Williama Edwarda Ayrtona. W następnym roku otrzymała certyfikat położnictwa od London Obstretic Society. Zaraz potem wyjechała z mężem do Japonii. Mężczyzna otrzymał bowiem profesurę w Imperial College Of Engineering w Tokio.
W Japonii Ayrton prowadziła badania antropologiczne i założyła szkołę dla położnych. Uczyła tam za pomocą tłumacza. W 1877 zachorowała na gruźlicę, co zmusiło ją do powrotu do Europy. W 1879 zaczęła doktorat w Paryżu. Jako pracę opublikowała wyniki swoich badań w Japonii, zatytułowane Dimensions générales et sur le développement du corps chez les Japonais (Paryż, 1879). W 1880 zdobyła licencjat w King and Queen's College of Physicians w Irlandii, gdzie była jedyną kobietą biorącą udział w egzaminach. Mieszkała w Londynie, gdzie badała choroby oka w Royal Free Hospital.