Muzeum Inkluzji w Bursztynie – uczelniane muzeum działające przy Uniwersytecie Gdańskim, specjalizujące się w inkluzjach organicznych w bursztynie.
Muzeum działa jako część Pracowni Entomologii Ewolucyjnej i Muzeum Inkluzji w Bursztynie w Katedrze Zoologii Bezkręgowców i Parazytologii na Wydziale Biologii Uniwersytetu Gdańskiego. Kierownikiem muzeum i pracowni jest dr hab. Jacek Szwedo.
Kolekcję muzeum stanowi prawie 6 tysięcy bryłek z ponad 15 tysiącami inkluzji zwierzęcych, jest to drugi co do wielkości zbiór w Polsce. Zbiory te służą przede wszystkim do celów naukowych. Muzeum i pracownia zajmują się oznaczaniem inkluzji, określając je do poziomu rzędów, a w przypadku muchówek – do poziomu rodziny. Za szczególnie cenne uważane są inkluzje, na podstawie których opisane zostały gatunki nowe dla nauki – w kolekcji muzeum w czerwcu 2020 znajdowały się 82 takie typy deskrypcyjne, takie jak muchówki, chrząszcze, pluskwiaki, błonkówki, siatkoskrzydłe, jętka, ważka oraz roztocze. W październiku 2022 łączna liczba tak opisanych gatunków wynosiła już 126.