stawiacze min: „Lindormen”, „Laaland”, „Lougen”, „Sixtus”, „Kvintus”, „Lossen” i okręt „Skagerak”, a okręt-bazę „Henrik Gerner” spalono. Spośród nich, torpedowiec „Sælen” podjął próbę wypłynięcia, ale została ona uznana za pozbawioną szans i zatopiono go w zachodniej części portu. Zatopiono też wycofany ze służby trałowiec (dawny torpedowiec) „Søhunden”, a bliźniaczy „Narhvalen” będący w remoncie został uszkodzony. W tym czasie niemieccy żołnierze opanowywali nabrzeża, doszło też do strzelanin. Do godziny 7 baza została zajęta, a duńscy oficerowie wzięci do niewoli. W Kopenhadze Niemcy zdobyli też okręty ochrony rybołówstwa „Beskyterren” i „Hejmdal”. Według i , „Hejmdal” został zatopiony, lecz nie potwierdza tego Gröner.
W Kalundborgu na północnym zachodzie Zelandii stacjonowały trałowce „Søhesten”, MS 2 i kutry patrolowe P6, P26 i P27. Jednostki te nie otrzymały rozkazu o samozatopieniu, prawdopodobnie z powodu zakłóceń w łączności, i około godziny 5 zostały zajęte przez niemieckich żołnierzy.