We wrześniu 2024 roku Isaacman dowodził misją Polaris Dawn, będącą częścią Programu Polaris. Załoga misji osiągnęła rekordowe apogeum wynoszące 1400 kilometrów, które później zostało obniżone do 700 kilometrów. 12 września 2024 roku załoga misji przeprowadziła wielogodzinne przygotowania do spaceru kosmicznego, podczas których wystawiono całą załogę na działanie próżni kosmicznej, chociaż Isaacman oraz Sarah Gillis indywidualnie przeprowadzili tak zwane Stand-up Extravehicular Activities lub SEVAs. Podczas pięciodniowego lotu załoga przeprowadziła około 40 eksperymentów naukowych. Załoga przeprowadziła również pierwszą załogową demonstrację komunikacji laserowej satelitów Starlink w przestrzeni kosmicznej.
Administrator NASA mały|Isaacman przemawia przed komisją zatwierdzającą
Pierwsza nominacja i odwołanie 4 grudnia 2024 roku Isaacman został nominowany przez Donalda Trumpa na 15. administratora NASA, stając się pierwszym w historii kandydatem agencji wybranym przez prezydenta elekta.