Powstanie kwietniowe i powstanie sierpniowe thumb|Niemieckie wyrzutnie rakietowe „Nebelwerfer” ostrzeliwujące polskie pozycje w czasie powstania warszawskiego. Na drugim planie, trzecia od lewej, kamienica przy ul. Żelaznej 103 thumb|Kamienica w 2023 roku 19 kwietnia 1943 roku, w dniu wybuchu powstania w getcie warszawskim, Niemcy uwięzili w Befehlstelle przewodniczącego Marka Lichtenbauma oraz pozostałych członków Judenratu. Cztery dni później zaprowadzono ich na Umschlagplatz, gdzie zostali rozstrzelani. Tego samego dnia, w którym zamordowano radców, grupa bojowników Żydowskiego Związku Wojskowego pod dowództwem Natana Szulca zaatakowała Befehlstelle, zamierzając uwolnić przetrzymywanych tam więźniów. Atak zakończył się niepowodzeniem, a większość bojowców poległa w walce.
Żydzi pracujący w Befehlstelle zostali rozstrzelani przez Niemców pod koniec kwietnia 1943 roku. W lipcu tegoż roku, już po stłumieniu powstania, komando SS opuściło Żelazną.