3 maja 1944 r. Teodor Pajewski został awansowany na stopień podporucznika na mocy wniosku sporządzonego przez Komendanta Obwodu IV AK. Legitymację AK o numerze 15059, którą sygnował podpisem Komendant Obwodu IV AK Rejon Śródmieście oficer organizacyjny – rotmistrz rezerwy kawalerii Romuald Jan Górski ps. „Bystry”, otrzymał 25 lipca1944 r. W sierpniu 1944 r., w trakcie Powstania Warszawskiego, Pajewski był żołnierzem batalionu AK im. Walerego Łukasińskiego (Batalion „Łukasiński”), rejon IV Śródmieście. Służył w 4. kompanii „Niemen” pod rozkazami porucznika Henryka Pokrzywnickiego ps. „Chwast”. Jednocześnie pełnił obowiązki zastępcy dowódcy I plutonu. W trakcie przeprowadzania – z rozkazu majora Olgierda Ostkiewicza-Rudnickiego ps. „Sienkiewicz” – inspekcji w rejonie Hali Mirowskiej został odcięty od swojego macierzystego oddziału. Udało mu się jednak przedostać kanałami do Śródmieścia, gdzie zgłosił się do dowództwa IV Rejonu przy ulicy Marszałkowskiej 125 i otrzymał przydział służbowy do Samodzielnego Plutonu Saperów, w którym pełnił obowiązki zastępcy dowódcy plutonu do spraw liniowych. Rozkazem Komendy Okręgu Warszawskiego AK nr 28 z 15 września 1944 r. (rotmistrz rezerwy kawalerii Romuald Jan Górski ps. „Bystry”) Teodor Pajewski otrzymał „Krzyż Walecznych".