Młodość Gabriel Gruber urodził się w Wiedniu w mieszczańskiej rodzinie pochodzenia słoweńskiego. Jego ojciec był płatnerzem. Został ochrzczony 6 maja 1740 roku w kościele Mariahilf. Otrzymał na chrzcie imiona Gabriel Erhard Jan Nepomucen. Miał trzech młodszych braci: Antona, Johanna-Nepomuka i Tobiasa, którzy również wstąpili do Towarzystwa JezusowegoМарек Инглот S.J.,, Общество Исуса в Российской Империи (1772-1820 гг.) и его роль в повсесестном востоновлении Ордена во всем мире, Институт фиорсофии, теологии и истории св. Фомы, Москва 2004, s. 146..
Edukację Gruber rozpoczął od studiów klasycznych w kolegium Jezuickim w Wiedniu. W czasie nauki w wieku 15 lat –18 października 1755 roku wstąpił do Towarzystwa Jezusowego. Nowicjat i studium łaciny i greki odbył w Leoben w latach 1757–1758. Następnie w latach 1758–1760 studiował w Grazu filozofię i teologię. Prócz tego podjął specjalne studia: fizyki, matematyki, rysunku, malarstwa, muzyki, medycyny(z zakresu chirurgii), astronomii oraz architektury cywilnej i wojskowej w Wiedniu (w latach 1760–1761 i 1762-1763) i Trrnawie (w latach 1761–1762).