Wyższe rośliny reprezentowane są chociażby przez modrzewnicę pospolitą, bagno zwyczajne, borówkę bagienną, bażynę czarną, żurawinę błotną, wełniankę pochwowatą, rosiczki okrągło- i długolistną, czermień błotną, siedmiopalecznik błotny czy przygiełkę białą.
Fauna Występujące na terenie CHKO Horná Orava zróżnicowane fitocenozy przekładają się na różnorodność występujących tam gatunków zwierząt. Spotkać można przedstawicieli fauny pól i łąk, terenów podmokłych, mokradeł, torfowisk, lasów iglastych i liściastych, gatunki alpejskie i stepowe. Dominują gatunki podgórskie, słabiej reprezentowane są gatunki górskie i występujące w południowej części parku zwierzęta ciepłolubne.
Najliczniejszą grupę zwierząt stanowią bezkręgowce, szczególnie bogato reprezentowane na terenach podmokłych, gdzie zachowały się gatunki reliktowe. Wśród pająków wymienia się m.in. gatunki Piratula hygrophila, P. uliginosa, Pirata piraticus, bagnika przybrzeżnego. W wyższych partiach gór występują chociażby Evansia merens czy Neomyrma rubida.