Decyzją Prezydenta RP z 23 stycznia 2023 roku Janusz Kapuśniak uzyskał tytuł profesora nauk rolniczych w dyscyplinie technologia żywności i żywienia. Od 1 września 2020 roku jest w Uniwersytecie przewodniczącym Rady Dyscypliny Naukowej dla Dyscypliny Technologia Żywności i Żywienia.
Odznaczenia i wyróżnienia – W 1996 r. został stypendystą Ministra Edukacji Narodowej,
– W 1997 r. otrzymał Nagrodę dla Najlepszego Absolwenta Wydziału Matematyczno-Przyrodniczego Wyższej Szkoły Pedagogicznej w Częstochowie – medal Bene Merentibus.
– W 2003 r. uzyskał Stypendium Krajowe Dla Młodych Naukowców Fundacji na rzecz Nauki Polskiej (START) – roczne stypendium dla wybitnego młodego uczonego na początku kariery naukowej posiadającego udokumentowane osiągnięcia w swojej dziedzinie badań. Stypendium to zostało mu przedłużone na 2004 r.
– W 2004 r. w zostało mu przyznane Stypendium Konferencyjne Fundacji na rzecz Nauki Polskiej i Towarzystwa Naukowego Warszawskiego.
– W 2006 r. Fundacja na rzecz Nauki Polskiej przyznała mu Stypendium Zagraniczne dla Młodych Doktorów (Kolumb) – stypendium na zagraniczny staż podoktorski, dzięki któremu odbył roczny staż naukowy w Department of Food Science and Human Nutrition w Iowa State University w USA pod opieką prof. Jay-lin Jane.