Payen porządkuje swoje życie prywatne i zawodowe. Zakupuje niewielką fabrykę w Juvisy-sur-Orge produkującą meble, 11 czerwca 1940 r. w Paryżu zawiera związek małżeński.
Nieoblatany Pa 22 wpadł w ręce wojsk niemieckich i wzbudził zainteresowanie Luftwaffe. Konstruktor został zmuszony do kontynuowania prac nad maszyną. Do jej oblotu doszło 18 października 1941 r. Pod pretekstem konieczności wprowadzenia zmian w konstrukcji Payen zmagazynował samolot w swej fabryce w Juvisy-sur-Orge. W 1943 r. fabryka i samolot zostały zniszczony podczas nalotu. thumb|Payen Pa 49 na Salonie Lotniczym w Paryżu Po zakończeniu działań wojennych Payen nadal pracował nad nowymi konstrukcjami lotniczymi w opatentowanym przez siebie układzie. Opracował maszynę Pa 49 „Katy” – pierwszy francuski odrzutowiec w układzie delta, napędzany silnikiem Turboméca Reaktor „Palas”. Jego oblotu dokonano 16 grudnia 1953 r. Maszyna została w 1967 r. zaprezentowana na Salonie Lotniczym w Paryżu. W latach pięćdziesiątych XX wieku założył stowarzyszenie „Les Amis du château feudal de Montlhéry”, które zajęło się odbudową zamku w Montlhéry.