Funkcję dyrektora muzeum sprawował do 1952, kiedy to został zwolniony przez władze z przyczyn światopoglądowych, ponieważ przedstawiał postać Kopernika nie tylko jako astronoma, lecz także jako kanonika diecezji warmińskiej i lekarza. Pewnego dnia wdał się w spór na tematy światopoglądowe z oficerem radzieckim. Gdy ten spytał go, jak można wierzyć w coś, czego nie widać, Ślizień odpowiedział, że przecież bieguna północnego też nie widać, a istnieje. Już następnego dnia otrzymał decyzję o zwolnieniu i przeniesieniu na stanowisko handlowca PSS „Społem” w Bielsku-BiałejKrzysztof Szczepanik Następcy Kopernika, Braniewskie Echa, nr 7 (8), 16 kwietnia 1990, s. 2.

Po jego odejściu zmieniono wygląd poszczególnych sal muzeum, uzupełniając je cytatami Engelsa i Stalina. Na stanowisko dyrektora przywrócono go dopiero w okresie odwilży gomułkowskiej w 1957 rokuFrombork. Była pracownia i syn o twórcy muzeum. Nie skarżył się na los, dziwił się głupocie [w:] IKAT. Gazeta Braniewska, 5 maja 2006 r., s. 5.