Równolegle zajmował się zagadnieniami programowania sterowników przemysłowych z uwzględnieniem zaleceń zawartych w normie IEC 61131-3.
Od roku 2011 prowadził badania nad półaktywnym tłumieniem drgań w pojazdach z wykorzystaniem tłumików magnetoreologicznych, których celem było poprawienie komfortu oraz bezpieczeństwa jazdy.
Zajmował się także zagadnieniami inteligentnej detekcji błędów w pracy maszyn na przykładzie przekrawacza w linii produkcji tektury.
Jerzy Kasprzyk jest autorem dwóch monografii i ponad 80 publikacji naukowych, oraz współautorem patentu nr 227773 na wynalazek pt. Sposób ustalania oraz identyfikacji defektów podzespołów tekturnicy, zwłaszcza przekrawacza. Aktywnie uczestniczył w wielu pracach naukowo-badawczych, kierował projektem Modelowanie i sterowanie w półaktywnych układach zawieszenia pojazdów mechanicznych, finansowanym przez Narodowe Centrum Nauki (NCN).
Był promotorem w 3 ukończonych przewodach doktorskich, recenzentem 5 prac doktorskich i 2 rozpraw habilitacyjnych.