Formalnie Memoriał funkcjonuje w ramach Fundacji od 14 stycznia 1997 roku.
W 2002 roku Fundacja zmieniła nazwę na Fundacja „Archiwum Pomorskie Armii Krajowej oraz Wojskowej Służby Polek”. Po śmierci Elżbiety Zawackiej w 2009 roku Fundacja zmieniła nazwę na obecną.
23 września 2014 roku przed siedzibą fundacji został odsłonięty pomnik Elżbiety Zawackiej.
Działalność Najstarszą i stałą formą działalności Fundacji jest Klub Historyczny, powstały jeszcze 24 lutego 1987 roku. Jej celem jest upowszechnianie znajomości historii ruchu oporu na Pomorzu, ze szczególnym uwzględnieniem dziejów Armii Krajowej i Tajnej Organizacji Wojskowej „Gryf Pomorski”. 27 lutego 1989 roku patronem Klubu został Antoni Antczak.
W ramach obchodów Narodowego Święta Niepodległości Fundacja organizuje sesje naukowe i popularnonaukowe. Pierwsze sesje odbywały się w Bibliotece Uniwersyteckiej w Toruniu, kolejne w Sali Mieszczańskiej w Ratuszu Staromiejskim lub w Sali Wielkiej Dworu Artusa w Toruniu.
Fundacja prowadzi działalność wydawniczą.