Po śmierci księdza ubrano w szaty liturgiczne, a osoby przebywające w tym miejscu modliły się przy jego ciele. Następnego dnia do domu powrócili żołnierze radzieccy, którzy, widząc go w liturgicznych szatach, zaczęli strzelać do okien i pobili gospodarza domu. Nakazali także pochować księdza w ogrodzie, co dokonano pod ich nadzorem – ciało owinięto w prześcieradło i złożono w płytkim grobie.
Pogrzeb W dniach 23–24 lipca 2024 odbyły się prace poszukiwawcze przeprowadzone przez Biuro Poszukiwań i Identyfikacji IPN na terenie dawnego gospodarstwa rodziny Kroschewskich, w trakcie których odnaleziono i ekshumowano ciało Franza Zagermanna.
Uroczystości pogrzebowe Franza Zagermanna odbyły się w dniach 5–6 września 2024 w Unikowie. W dniu 5 września miało miejsce wprowadzenie trumny do kościoła parafialnego i Msza Święta pod przewodnictwem bpa Janusza Ostrowskiego. 6 września odbyła się natomiast Msza Święta pogrzebowa pod przewodnictwem abpa Józefa Górzyńskiego i złożenie do grobu na miejscowym cmentarzu.