Wczesne życie i rodzina Georg Pfeffer urodził się 17 stycznia 1943 roku w Berlinie w Niemczech jako syn Karla Heinza Pfeffera i Margaret Wainman Kirby. Jego ojciec był socjologiem. Jego matka była Brytyjką. Musiał opuścić swoje rodzinne miasto z powodu bombardowań pod koniec drugiej wojny światowej. We wczesnym dzieciństwie mieszkał w wiosce w Hesji, gdzie miał kontakt z uchodźcami i doświadczył „struktur społecznych” niemieckich obszarów wiejskich. W 1949 roku rodzina Pfefferów przeniosła się do Hamburga, gdzie ukończył szkołę.
Edukacja Kiedy Georg Pfeffer miał 16 lat, rodzina Pfefferów przeniosła się do Lahore w Pakistanie. W latach 1959–1962 studiował w Forman Christian College. W tym czasie poznał również kulturę, społeczeństwo i język Pakistanu. Później powrócił do Niemiec. W 1966 r. zaczął studiować historię religii, socjologię i etnologię na Uniwersytecie we Fryburgu. Jego nauczycielami na uniwersytecie byli między innymi i Heinrich Popitz. W 1970 r. ukończył doktorat na uniwersytecie. W ramach doktoratu przedstawił monografiaic dysertację zatytułowaną Pariagruppen des Pandschab (Pariah Groups of Punjab).