Pod jego nadzorem został przekształcony w jedyny nazistowski obóz zagłady na terytorium Włoch. Obóz był używany do przetrzymywania zakładników, partyzantów i więźniów politycznych, a także jako obóz zbiorczy i przejściowy dla Żydów deportowanych do nazistowskich obozów koncentracyjnych. W październiku 1943 roku rozpoczęły się aresztowania i otwarto obóz, w którym pracowali głównie niemieccy i ukraińscy członkowie SS pod dowództwem SS-Sturmbannführera Christiana Wirtha, byłego dowódcy obozu zagłady w Bełżcu. Wirth został zabity przez jugosłowiańskich partyzantów w Opatii 26 maja 1944 roku. Zastąpił go były zastępca Wirtha w Lublinie i następca w Bełżcu, SS-Hauptsturmführer Gottlieb Hering. Heringa zastąpił SS-Obersturmbannführer w sierpniu 1944 roku. 28 kwietnia 1945 roku obóz San Sabba zakończył działalność, a oddziały Waffen-SS uwolniły pozostałych więźniów i następnego dnia zburzyły budynek komory gazowej i spalarni, aby zniszczyć dowody zbrodni wojennych.
Ponad 25 000 włoskich, słoweńskich, chorwackich i żydowskich cywilów przeszło przez obóz San Sabba, około 5000 zostało tam zabitych różnymi metodami, w tym przez . Obecnie młyn ryżowy jest włoskim Narodowym Miejscem Pamięci.