Służba U-557 został wcielony do służby w Kriegsmarine 13 lutego 1941 roku. Dowództwo okrętu objął por. mar. (niem. Oberleutnant zur See) Ottokar Arnold Paulssen, dowodzący wcześniej U-20. U-Boot otrzymał numer poczty polowej M 37 961. Do 1 maja 1941 roku załoga jednostki przechodziła szkolenie w składzie 1. Flotylli U-Bootów, operując z Kilonii. Podczas jednego z rejsów szkoleniowych na Morzu Bałtyckim okręt miał wypadek podczas manewru zanurzenia, w wyniku którego osiadł na dnie (zginął marynarz o nazwisku Eckstein).
Pierwszy rejs bojowy 13 maja 1941 roku U-Boot wyszedł z Kilonii, udając się na swój pierwszy wojenny patrol. 24 maja U-557, U-43, U-46, U-66 i U-94 otrzymały od admirała Karla Dönitza rozkaz utworzenia zasadzki na brytyjskie okręty ścigające pancernik „Bismarck” w odległości około 360 Mm na południe od Grenlandii. W dniach 25 maja – 20 czerwca okręt wchodził w skład wilczego stada . 29 maja o godzinie 20:43 na południe od przylądka Farvel U-Boot storpedował marudera z konwoju HX-128, zbudowany w 1941 roku brytyjski parowiec „Empire Storm” o pojemności 7290 BRT, płynący z ładunkiem 6494 ton zboża i 2983 ton mąki z Montrealu na Wyspy Brytyjskie.