Rozmieszczenie geograficzne Szczekuszka jenisejska zamieszkuje środkową Syberię pomiędzy środkowym i dolnym albo południowym Jenisejem oraz Leną w jej środkowym biegu. Sięga jeziora Bajkał. Cieszy się szerokim zasięgiem występowania.
Ekologia Siedlisko szczekuszki jenisejskiej to tereny skaliste. Zasiedla klify i szczyty wzgórz, kamieniste zbocza na północnych częściach wzgórz, jak również przyległe szczyty i wzgórza w okolicach źródeł i porosłych lasem iglastym. Nie lubi niestabilnych zboczy. Sięga wysokości od 100 do 1100 m nad poziomem morza. Kryje się pomiędzy kamieniami, w szczelinach i jamach. Niemniej kiedy osiąga znaczące zagęszczenie, zajmuje także powalone drzewa, kryje się między korzeniami.
Zwierzę występuje pospolicie choćby w górach Putorana, a być też w innych, niedosięgłych miejscach. Sympatrycznie do niego żyje szczekuszka północna.