Jednak mecz przeciwko Rennes nie poszedł tak dobrze – został zmieniony w przerwie przy stanie 0:3, mając trudności na pozycji lewego wahadłowego. Lyon dokonał pięciu innych transferów w tym oknie, więc musiał walczyć o miejsce w składzie. W związku z transferem Saïda Benrahmy z West Ham w pozostałej części sezonu wyszedł w podstawowym składzie tylko trzy razy w lidze.
Mimo to, często wchodząc z ławki rezerwowych, przyczynił się do powrotu Lyonu z okolic strefy spadkowej na pozycje europejskie. Strzelił zwycięską bramkę w doliczonym czasie przeciwko Monaco oraz wyrównującego gola przeciwko Lille w meczu zakończonym wynikiem 4:3.
Sezon 2024/25 Sezon 2024/25 był przełomowy dla Fofany. 19-latek uczynił lewą flankę swoją domeną, strzelając pięć bramek w sześciu meczach między końcem września a początkiem listopada. Szczególnie imponujący był jego występ w Lidze Europy przeciwko Rangers w Glasgow – strzelił dwa gole i zanotował asystę w wygranym 4:1 meczu.
W wieku 19 lat i 186 dni stał się najmłodszym zawodnikiem w historii Lyonu, który w europejskim meczu strzelił dublet i zanotował asystę. Trener Pierre Sage chwalił go: „Wysłał bardzo mocny sygnał, pokazując, że może zaczynać mecze i od razu być skuteczny".